医院于1949年6月在福州成立，1956年11月与设在闽侯白沙汶溪的省第六康复医院合并，1960年在福州古屏路建立省皮肤病研究所。1980年更名为福建省皮肤病防治院。1987年迁回福州市，1990年医院更名为福建省皮肤病性病防治院。福建省皮肤病性病防治院是一所集医疗、科研、防治于一体的省级皮肤病专科医院，医院毗邻福州台江中亭街繁华商贸区，座落于江滨大道解放大桥（即万寿桥）右侧。院内设有皮肤科、皮肤外科、性病科、中西医结合皮肤科、特诊科等六个临床科室，编制床位100张，年门诊量17万人次以上。

医院承担全省皮肤病、性病的临床诊疗、科研及培训任务，是卫生部首批确定的16个全国性病监测点之一，先后与英、比、日、韩、美及荷兰等国建立了技术交流和业务协作关系。现有**技术职称9人，所有院领导、临床医生均有大学及以上学历，并经过国内外知名专业机构进修深造，有多人在省级及国家学术团体担任主任委员、副主任委员、常务理事等职和国内多家**专业期刊的常务编委、编委。医院引进了一大批国内外先进专科诊疗设备，凭借自身雄厚的技术力量、先进的医疗设备、丰富的临床经验，开展了白癜风、银屑病、异位性皮炎、大疱性皮肤病、真菌病、毛发病、职业性皮肤病、美容激光、性病等特色诊疗，并取得了显著疗效，为许多患者带来了健康福音。

医院被授予“全国卫生防疫防治工作先进集体”及省、市、区“文明单位”称号。知名专家、学科带头人有：林伯滢、何成雄、胡荔红。