医院下设“三科一室”。即医务科、预防科、行政科、办公室。

医务科有内科、外科、中医科、口腔科、肠道科、放射科、化验室、中西药房、理疗室、换药室、B超心电图室、注射室、拥有110只床的内科、骨科病房等科室。负责塘湾镇居民及“市六”医院双向转诊转来骨科病人的治疗工作。核定床位100张，实际开放床120张。

预防科有计划免疫、环境卫生、劳动卫生、“两管”、生命统计、工地卫生、传染病管理、疫点处理、学校卫生、血吸虫防治、健康教育、合作医疗管理、妇、儿保健、慢性病防治等条线组成。