为了改善病人就医环境，从2004年开始对旧病房周围环境和医疗流程进行彻底改造，目前已完成整体改造的一期和二期工程，整体改造完成后的惠福分院医疗用房面积达23000多平方米，共设病床150张，其中有呼吸病区和血管神经病区病房、重症监护单元(ICU)、精神心理康复病房等。医疗用房全部使用中央空调，并增加了四台手扶电梯、二台垂直升降医用电梯。门前建有2300多平方米的花园，地下停车场1700—3000多平方米，可停车200多辆。上述工程完工后，一个崭新的惠福分院将屹立于广州市的老城区。
目前在该分院上班的职工有300余人，其中**技术人员100多人，日门诊量2000多人次。门诊设有普通门诊、专家门诊、名老专家门诊。现有呼吸内科、消化内科、心血管科、神经内科、内分泌科、肝病专科、风湿免疫科、外科、儿科、中医科、妇产科、耳鼻喉科、眼科、口腔科、皮肤科、针灸理疗康复科、中医正骨科、精神心理科、社区健康服务中心、健康体检保健中心。共有诊室130多间。技诊科室有：放射科、CT室、心电功能室、彩色和黑白B超室、检验科、神经电生理室、精神心理检查室、精神心理治疗室、广东省精神疾病鉴定中心、血库等。其它科室有：西药房、中药房、中心注射室、门诊集中手术室、供应室、营养室及饭厅、挂号收费处、各种检查治疗住院、门诊预约中心、入院处、出院处、病案室、行政办公室。
广东省精神心理研究所下设还有7个研究室，如生物精神医学研究室、医学心理研究室、药物依赖研究室、少年心理卫生研究室、社会精神医学研究室、睡眠研究室、司法精神病研究室;岭南精神医学编辑部等。
广东省检验中心除完成惠福分院临床检验标本的检查工作外，还肩负着全省检验质量的管理和技术监督和指导任务，设有临床血液学分析参考实验室和检验质量控制办公室。