越秀区人民医院前身是邝磐石私立医院。民国4年（1915）邝磐石通过广东省警察厅厅长魏邦平征购广州市东郊梳头岗（又称木棉岗）东北麓的地皮筹建医院。
民国8年医院建成开业，民国9～26年是邝磐石医院业务最旺的时期，广州沦陷时期，邝磐石医院迁出，日本投降后，医院迁回，并逐步修复。
1958年7月邝磐石将医院交东区人民政府接管，改为东区人民医院。80年代以来，区人民医院得到全面发展，成为东山区规模较大的综合性医院和东山区医疗技术指导中心。
2005年10月区划调整后更名为越秀区人民医院。