小儿先天性心脏病外科治疗，尤其是婴幼儿复杂性先心病手术治疗。各种小儿先天性胸部畸形，如：先天性漏斗胸、鸡胸、肋骨发育畸形、肺囊肿、食道闭锁、食道裂孔疝、膈疝、膈膨升、食道狭窄、肿瘤，肺发育不良等，各种小儿急诊，如：支气管异物、急慢性心包炎、胸膜炎、心胸外伤等。

近五年，获国家自然科学基金中加合作重大项目、重点项目和面上项目居儿科界前列，获科技部“863”计划、国家“科技支撑计划”、“卫生行业科研专项”合作项目10余项、承担“973”子课题3项。获重庆市科技进步一等奖、教育部科技进步二等奖、“宋庆龄儿科医学奖及成果奖”、中华医学奖等30余项。近三年发表SCI200余篇、CSCD论文453篇。主办《儿科药学杂志》。,拥有美敦力神经导航系统、德国目乐神经外手术显微镜、Valleylab超声吸引器、术中超声仪、Nicolet术中脑电监测系统、蛇牌开颅动力系统、蛇牌脑室内窥镜、蛇牌电凝电刀、DORO头架、DORO脑牵开器和各种进口手术器械等。