消化内科疑难病、危重病的诊断和治疗；慢性肝病，包括慢性乙肝、慢性丙肝、脂肪性肝病、酒精性肝病、自身免疫性肝病等的诊断治疗；肝硬化及其合并症(上消化道出血、肝腹水、肝昏迷、肝肾综合征等)的诊断治疗；慢性胃肠病的治疗。

近来年，医院先后获科技成果奖19项，其中获省部级二等奖以上、国家三等奖以上成果奖19项，发表学术论文1500余篇，承办国际、全国及全军大型学术会议80多次。2002年及2003年连续两年获四川省科技进步一等奖。,医院引进和购置了多种现代化的诊疗设备，如PET/CT、核磁共振成象仪、螺旋CT、直线加速器、头部及体部X一刀、1250MAX光机、前列腺射频治疗仪、血细胞分离机及多种型号的B超声仪，设备总价值为1亿5千余万元，为临床的诊治和治疗提供了先进的硬件保障。