类风湿、红斑狼疮、硬皮病、多发性肌炎、痛风、重症肌无力、甲亢、肝硬化腹水、肝肿瘤、胃和十二指肠球部溃疡、胃癌、贲门癌、脑出血、脑血栓、癫痫、冠心病、心肌炎、多形性红斑、哮喘、渗出性胸膜炎、糖尿病神经病变、顽固失眠、重度贫血、多发性骨髓瘤等难治性疾病

医院先后获国家各级科技成果奖130多项，其中“中医药治疗脑部胶质瘤的观察”获国家科技进步二等奖，“一种治疗更年期综合征的中药复方制剂及制备方法”获中华中医药学会科技发明一等奖。医院研制了参麦注射液、丹桃合剂、降糖丸、更年宁心胶囊等多个国家新药。研制了工艺独特、安全有效的院内制剂300余种。目前承担省部级和重庆市卫生局建设项目和科研项目80多个。,医院拥有64排和16排螺旋CT、1.5T核磁共振、直接数字化放射成像系统、1000毫安多功能数字X光机、全自动生化、大型数控放疗系统、彩超等大型医疗设备200余台，医疗设备总值2亿多元